目前我国中小企业阿米巴经营模式普遍存在的问题：

1.运营模式的片面化。在国内中小企业的管理中，大多数企业只是复制阿米巴模式的表面，而不是其核心。内部交易价格和成本分担，大家很难达成一致；阿米巴绩效考核并不与员工挂钩，通常只是是对表现好的阿米巴单位进行表扬和激励。运营模式的片面性很容易导致内部交易价格的失衡，从而导致阿米巴之间为了个人利益无休止的争论。

(1)企业文化宣导

   商业模式导入前的哲学思想共识，不断消除企业人员缺乏阿米巴经营管理意识的问题，增强其思想意识。阿米巴主要以思想管理和经营为主，所以更需要增强员工的思想意识，发现问题，解决问题。在导入经营模式之前，要加强管理，做好哲学思想意识学习，了解阿米巴经营模式的本质，从而达到全员参与的目的。通过哲学指导，形成企业特有的文化。在这样的环境下，阿米巴的商业模式更容易被接受和执行。管理层明白哲学是基础，贯彻经营管理哲学，让员工实现“哲学共享”是目标。员工为企业工作是物质和精神上的满足。把抽象的哲学概念运用到实际工作中，让思想在吃饱肚子的前提下更有必要影响行为。